CosMx SMI débloque l'imagerie du génome complet au niveau cellulaire unique : une révolution pour la biologie spatiale

NanoString Technologies, Inc. (NASDAQ : NSTG), un innovateur de premier plan dans les outils de recherche en sciences de la vie, a dévoilé une avancée technologique majeure avec sa plateforme CosMx Spatial Molecular Imager. La société a publié son premier ensemble de données publiques démontrant la capture de l’ensemble du transcriptome à une résolution véritablement single-cell, marquant un moment clé dans la recherche en biologie spatiale. Cette réalisation sera présentée lors de la 42e Conférence sur la santé J.P. Morgan 2024 à San Francisco, prévue pour le 10 janvier 2024 à 17h15 ET.

Capacité d’imagerie révolutionnaire qui transforme la recherche sur les cellules uniques

Le panel transcriptomique complet CosMx représente un tournant dans la technologie d’imagerie génomique. NanoString est la première à offrir une visualisation véritable du transcriptome entier à l’échelle d’une seule cellule, permettant l’imagerie simultanée de presque tous les gènes codant pour des protéines dans le génome humain au sein de sections de tissus préservés. Cette capacité redéfinit fondamentalement ce que les chercheurs peuvent extraire des échantillons de tissus fixés au formol et inclus en paraffine (FFPE).

En capturant environ 19 000 gènes en une seule session d’imagerie, la plateforme CosMx offre une couverture génétique près de 40 fois supérieure à celle des solutions concurrentes existantes. Cette portée analytique élargie permet aux chercheurs de traiter des millions de cellules par expérience, d’identifier des populations cellulaires rares que les méthodes conventionnelles manquent souvent, et de contextualiser les interactions cellulaires dans leur environnement tissulaire natif. L’approche fournit des insights comparables ou supérieurs à ceux du séquençage d’ARN à cellule unique (scRNA-seq) tout en réduisant les coûts d’analyse par cellule et en accélérant le débit cellulaire.

La société prévoit de lancer le panel transcriptomique complet CosMx sur le marché commercial en 2025, avec des prototypes générant déjà des résultats de recherche convaincants.

Ensemble de données sur le tissu pancréatique révélant une complexité cellulaire cachée

NanoString a rendu accessible au public un ensemble de données révolutionnaire du transcriptome complet, généré à partir de tissus pancréatiques humains sains utilisant la plateforme CosMx. Cet ensemble de données met en évidence l’architecture cellulaire fonctionnelle du tissu pancréatique, révélant des populations cellulaires rares que les méthodes de séquençage traditionnelles ne parviennent généralement pas à préserver ou à identifier.

Grant R. Kolar, M.D., Ph.D., Directeur de la recherche en microscopie et histologie au Saint Louis University School of Medicine, a commenté les implications de la recherche : « Avec le panel transcriptomique complet CosMx, nous pouvons désormais étudier des questions biologiques fondamentales sur les relations entre l’anatomie et la fonction des îlots pancréatiques, qui restent inaccessibles avec des approches d’imagerie à complexité inférieure. Cette capacité transformative promet de reshaper notre compréhension de la biologie normale des îlots et de débloquer de nouvelles perspectives thérapeutiques sur la physiopathologie du diabète, ce qui pourrait accélérer le développement de stratégies de traitement innovantes. »

L’ensemble de données actuel a été généré à l’aide d’un instrumentation prototype et d’un logiciel analytique associé ; la performance de niveau commercial dépassera ces résultats initiaux à mesure que la technologie atteindra sa pleine maturité.

Capacités élargies de la plateforme à venir sur le marché

Au-delà de l’avancée dans le transcriptome complet, NanoString maintient son calendrier de développement pour le panel de découverte CosMx Human 6K, prévu pour une disponibilité commerciale début 2024Q1. Ce test de nouvelle génération offre une multiplexage six fois supérieur à celui des configurations CosMx existantes, permettant aux chercheurs de disséquer les états cellulaires avec une granularité accrue, de cartographier des réseaux de communication intercellulaires complexes, et de caractériser les réponses spatiales aux stimuli biologiques avec une résolution sans précédent.

La communauté scientifique pourra voir d’autres ensembles de données de validation lors de la conférence AGBT (du 5 au 8 février 2024, à Orlando, en Floride), où les utilisateurs de CosMx présenteront des résultats d’imagerie transcriptomique spatiale issus de recherches sur le cancer du pancréas, le cancer colorectal et le tissu cérébral humain.

Plateforme complète de biologie spatiale

L’écosystème intégré de NanoString répond à l’ensemble des besoins en recherche en biologie spatiale. Le GeoMx Digital Spatial Profiler combine l’imagerie au niveau tissulaire avec un profilage simultané des gènes et des protéines, permettant une analyse spatiale complète à plusieurs échelles biologiques. La plateforme CosMx se spécialise dans l’imagerie à cellule unique alimentée par la multi-omique spatiale, permettant aux chercheurs de reconstruire les paysages cellulaires avec une précision à l’échelle d’une seule cellule. La plateforme AtoMx Spatial Informatics fournit une analyse basée sur le cloud et des outils collaboratifs, démocratisant les insights en biologie spatiale dans les institutions de recherche. Le système d’analyse nCounter continue de servir d’outil fondamental pour le profilage de centaines de gènes, protéines, microARN et variations du nombre de copies avec une haute sensibilité et précision.

Considérations prospectives

Cette annonce reflète la confiance de NanoString dans l’adoption de ses solutions de biologie spatiale sur le marché, bien que les résultats réels puissent varier en fonction de la dynamique concurrentielle, des conditions économiques, des calendriers de fabrication et d’autres facteurs de marché détaillés dans les dépôts SEC de la société. La société décline toute obligation de mettre à jour ses déclarations prospectives au-delà de la date de publication actuelle.

NanoString, GeoMx, CosMx, AtoMx et nCounter sont des marques déposées de NanoString Technologies, Inc. dans diverses juridictions.

Contact : Doug Farrell, Vice-président des relations investisseurs et de la communication d’entreprise, Dfarrell@nanostring.com, Tél. : 206-602-1768

Source : NanoString Technologies, Inc.