CosMx SMI Membuka Kunci Pencitraan Genom Penuh di Tingkat Sel Tunggal: Sebuah Terobosan untuk Biologi Spasial

NanoString Technologies, Inc. (NASDAQ: NSTG), pelopor terkemuka dalam alat penelitian ilmu kehidupan, telah mengungkapkan kemajuan teknologi signifikan dengan platform CosMx Spatial Molecular Imager-nya. Perusahaan merilis dataset publik pertamanya yang menunjukkan penangkapan seluruh transkriptom dengan resolusi sel tunggal yang nyata, menandai momen penting dalam penelitian biologi spasial. Prestasi ini akan dipamerkan di Konferensi Kesehatan J.P. Morgan ke-42 2024 di San Francisco, dijadwalkan pada 10 Januari 2024, pukul 17:15 ET.

Kemampuan Pencitraan Revolusioner Mengubah Penelitian Sel Tunggal

Panel Whole Transcriptome CosMx mewakili momen penting dalam teknologi pencitraan genom. NanoString menjadi yang pertama menghadirkan visualisasi transkriptom seluruh sel tunggal yang sesungguhnya, memungkinkan pencitraan simultan hampir setiap gen yang mengkode protein dalam genom manusia dalam bagian jaringan yang dipertahankan. Kemampuan ini secara fundamental mendefinisikan ulang apa yang dapat diekstraksi peneliti dari sampel jaringan (FFPE) yang difiksasi formalin dan diembed dalam parafin.

Dengan menangkap sekitar 19.000 gen dalam satu kali pencitraan, platform CosMx memberikan cakupan gen hampir 40 kali lebih besar dibandingkan solusi kompetitif yang ada. Lingkup analisis yang diperluas ini memberdayakan peneliti untuk memproses jutaan sel per eksperimen, mengidentifikasi populasi sel yang sulit ditemukan oleh metode konvensional, dan mengontekstualisasikan interaksi seluler dalam lingkungan jaringan aslinya. Pendekatan ini memberikan wawasan yang sebanding atau lebih baik dari sequencing RNA sel tunggal tradisional (scRNA-seq) sambil mengurangi biaya analisis per sel dan mempercepat throughput seluler.

Perusahaan bermaksud memperkenalkan Panel Whole Transcriptome CosMx ke pasar komersial pada tahun 2025, dengan prototipe yang saat ini menghasilkan hasil penelitian yang menarik.

Dataset Jaringan Pankreas Mengungkap Kompleksitas Sel Tersembunyi

NanoString telah membuat dataset transkriptom lengkap yang inovatif yang dihasilkan dari jaringan pankreas manusia sehat menggunakan platform CosMx tersedia secara publik. Dataset ini menampilkan arsitektur seluler fungsional jaringan pankreas, mengungkapkan populasi sel langka yang biasanya gagal dipertahankan atau diidentifikasi oleh metode sequencing tradisional.

Grant R. Kolar, M.D., Ph.D., Direktur Riset Mikroskopi dan Inti Histologi di Saint Louis University School of Medicine, berkomentar tentang implikasi penelitian: “Dengan Panel Whole Transcriptome CosMx, kita sekarang dapat menyelidiki pertanyaan biologis mendasar tentang hubungan anatomi-fungsi pulau pankreas yang sebelumnya tidak dapat diakses oleh pendekatan pencitraan dengan kompleksitas lebih rendah. Kemampuan transformatif ini berjanji untuk mengubah pemahaman kita tentang biologi pulau normal dan membuka wawasan terapeutik baru tentang patofisiologi diabetes, yang berpotensi mempercepat pengembangan strategi pengobatan inovatif.”

Dataset saat ini dihasilkan menggunakan instrumen prototipe dan perangkat lunak analitik terkait; kinerja tingkat komersial akan melebihi hasil awal ini saat teknologi mencapai kematangan penuh.

Kemampuan Platform yang Diperluas Akan Segera Masuk Pasar

Selain kemajuan transkriptom lengkap, NanoString mempertahankan jadwal pengembangan untuk Panel Penemuan Manusia 6K CosMx, yang diperkirakan akan tersedia secara komersial mulai Q1 2024. Asesmen generasi berikut ini menyediakan multiplexing enam kali lebih tinggi dibandingkan konfigurasi CosMx yang ada, memungkinkan penyelidik untuk membedah keadaan sel dengan granularitas yang lebih tinggi, memetakan jaringan komunikasi antar sel yang rumit, dan mengkarakterisasi respons spasial terhadap rangsangan biologis dengan resolusi yang belum pernah terjadi sebelumnya.

Komunitas ilmiah akan menemukan dataset validasi tambahan selama konferensi AGBT (5-8 Februari 2024, Orlando, Florida), di mana pengguna CosMx akan mempresentasikan hasil transkriptom spasial dari kanker pankreas, kanker kolorektal, dan penelitian jaringan otak manusia.

Platform Biologi Spasial Komprehensif

Ekosistem terintegrasi NanoString menangani seluruh spektrum kebutuhan penelitian biologi spasial. GeoMx Digital Spatial Profiler menggabungkan pencitraan tingkat jaringan dengan profil gen dan protein secara bersamaan, memungkinkan analisis spasial lengkap di berbagai skala biologis. Platform CosMx khusus dalam pencitraan sel tunggal yang didukung oleh multiomics spasial, memungkinkan peneliti merekonstruksi lanskap seluler dengan presisi sel tunggal. AtoMx Spatial Informatics Platform menyediakan analisis berbasis cloud dan alat kolaboratif, mendemokratisasi wawasan biologi spasial di berbagai institusi penelitian. Sistem Analisis nCounter terus berfungsi sebagai alat dasar untuk memprofil ratusan gen, protein, mikroRNA, dan variasi jumlah salinan dengan sensitivitas dan presisi tinggi.

Pertimbangan ke Depan

Pengumuman ini mencerminkan kepercayaan NanoString terhadap adopsi pasar solusi biologi spasialnya, meskipun hasil aktual dapat bervariasi berdasarkan dinamika kompetitif, kondisi ekonomi, jadwal manufaktur, dan faktor pasar lain yang dirinci dalam pengajuan SEC perusahaan. Perusahaan menolak untuk berkomitmen memperbarui pernyataan ke depan di luar tanggal rilis saat ini.

NanoString, GeoMx, CosMx, AtoMx, dan nCounter merupakan merek dagang terdaftar dari NanoString Technologies, Inc. di berbagai yurisdiksi.

Kontak: Doug Farrell, Wakil Presiden Hubungan Investor & Komunikasi Korporat, Dfarrell@nanostring.com, Telepon: 206-602-1768

Sumber: NanoString Technologies, Inc.