CosMx SMI відкриває повне геномне уявлення на рівні окремої клітини: революція у просторовій біології

NanoString Technologies, Inc. (NASDAQ: NSTG), провідний інноватор у галузі інструментів для досліджень у сфері наук про життя, представила значний технологічний прорив із платформою CosMx Spatial Molecular Imager. Компанія випустила свій перший публічний набір даних, що демонструє захоплення цілого транскриптома з роздільною здатністю окремої клітини, що є важливим моментом у дослідженнях просторової біології. Цей досягнення буде продемонстровано на 42-й конференції J.P. Morgan Healthcare Conference 2024 у Сан-Франциско, запланованій на 10 січня 2024 року о 17:15 за східним часом.

Революційна можливість візуалізації трансформує дослідження окремих клітин

Панель цілого транскриптома CosMx представляє собою переломний момент у технології геномної візуалізації. NanoString стала першою, хто забезпечив справжню візуалізацію цілого транскриптома окремої клітини, що дозволяє одночасно зображати майже кожен ген, що кодує білок у людському геномі, у збережених тканинних зразках. Ця можливість кардинально переосмислює, що дослідники можуть отримати із формалін-фіксованих парафінових зразків тканин (FFPE).

Захоплюючи приблизно 19 000 генів за один запуск зображення, платформа CosMx забезпечує майже у 40 разів більше охоплення генів у порівнянні з існуючими конкурентними рішеннями. Цей розширений аналітичний спектр дозволяє дослідникам обробляти мільйони клітин за один експеримент, виявляти рідкісні популяції клітин, які зазвичай пропускають традиційні методи, та контекстуалізувати клітинні взаємодії у їхньому природному тканинному середовищі. Підхід забезпечує порівнянні або кращі результати порівняно з традиційним scRNA-seq, одночасно зменшуючи витрати на аналіз кожної клітини та прискорюючи обробку клітин.

Компанія планує вивести панель цілого транскриптома CosMx на комерційний ринок у 2025 році, при цьому прототипи вже демонструють переконливі результати досліджень.

Dataset тканини підшлункової залози виявляє приховану клітинну складність

NanoString зробила публічно доступним революційний набір даних цілого транскриптома, отриманий із здорової людської тканини підшлункової залози за допомогою платформи CosMx. Цей набір даних демонструє функціональну клітинну архітектуру тканини підшлункової залози, виявляючи рідкісні клітинні популяції, які традиційні методи секвенування зазвичай не зберігають або не ідентифікують.

Грант Р. Колар, M.D., Ph.D., директор дослідницького мікроскопічного та гістологічного ядра у Школі медицини Університету Святого Луїса, прокоментував значення дослідження: “З панеллю цілого транскриптома CosMx ми тепер можемо досліджувати фундаментальні біологічні питання про анатомо-функціональні зв’язки острівців підшлункової залози, які залишаються недоступними для менш складних методів візуалізації. Ця трансформаційна можливість обіцяє змінити наше розуміння нормальної біології острівців і відкрити нові терапевтичні інсайти у патофізіології діабету, що потенційно прискорить розробку інноваційних стратегій лікування.”

Поточний набір даних був отриманий за допомогою прототипного обладнання та відповідного аналітичного програмного забезпечення; комерційна версія з високою продуктивністю перевищить ці початкові результати, коли технологія досягне повної зрілості.

Розширені можливості платформи скоро на ринку

Крім розвитку цілого транскриптома, NanoString зберігає свій графік розробки для CosMx Human 6K Discovery Panel, який очікується для комерційної доступності починаючи з першого кварталу 2024 року. Цей новий аналізатор забезпечує шість разів вищу мультиплексність у порівнянні з існуючими конфігураціями CosMx, що дозволяє дослідникам детальніше досліджувати стан клітин, мапувати складні міжклітинні комунікаційні мережі та характеризувати просторові відповіді на біологічні стимули з безпрецедентною роздільною здатністю.

Наукова спільнота ознайомиться з додатковими наборами даних для валідації під час конференції AGBT (5-8 лютого 2024 року, Орландо, Флорида), де користувачі CosMx представлять результати просторової транскриптоміки з досліджень раку підшлункової залози, колоректального раку та людської мозкової тканини.

Всеохоплююча платформа просторової біології

Інтегрована екосистема NanoString охоплює весь спектр досліджень у галузі просторової біології. GeoMx Digital Spatial Profiler поєднує зображення тканинного рівня з одночасним профілюванням генів і білків, забезпечуючи всебічний просторовий аналіз на різних біологічних масштабах. Платформа CosMx спеціалізується на візуалізації окремих клітин за допомогою просторової мультиоміки, дозволяючи дослідникам відновлювати клітинні ландшафти з точністю до окремої клітини. Платформа AtoMx Spatial Informatics забезпечує хмарний аналіз і інструменти для співпраці, демократизуючи інсайти просторової біології для дослідницьких установ. Система аналізу nCounter продовжує бути базовим інструментом для профілювання сотень генів, білків, мікроРНК та варіацій кількості копій із високою чутливістю та точністю.

Перспективні міркування

Це оголошення відображає впевненість NanoString у прийнятті її рішень у галузі просторової біології, хоча реальні результати можуть варіюватися залежно від конкурентних динамік, економічних умов, термінів виробництва та інших ринкових факторів, детально описаних у документах компанії SEC. Компанія відмовляється від зобов’язань оновлювати прогнози за межами поточної релізної дати.

NanoString, GeoMx, CosMx, AtoMx та nCounter є зареєстрованими торговими марками NanoString Technologies, Inc. у різних юрисдикціях.

Контакт: Даг Фаррелл, віце-президент з інвесторських відносин та корпоративних комунікацій, Dfarrell@nanostring.com, Телефон: 206-602-1768

Джерело: NanoString Technologies, Inc.